Pneumologie 2015; 69 - P155
DOI: 10.1055/s-0035-1544822

MicroRNA Expressions-Profile von epithelialer Lining Fluid (ELF) und bronchoalveolärer Lavage (BAL) bei idiopathischer Lungenfibrose (IPF)

N Kahn 1, M Meister 2, R Eberhardt 1, T Muley 2, U Oltmanns 1, E Baroke 1, K Palmowski 1, FJF Herth 1, M Kreuter 1
  • 1Pneumologie und Beatmungsmedizin, Thoraxklinik am Universitätsklinikum Heidelberg; Translational Lung Research Center (TLRC) Heidelberg, Member of the German Center for Lung Research (DZL)
  • 2Sektion für transnationale Forschung, Thoraxklinik am Universitätsklinikum Heidelberg; Translational Lung Research Center (TLRC) Heidelberg, Member of the German Center for Lung Research (DZL)

Einleitung: Zur Diagnostik und Risikobewertung interstitieller Lungenerkrankungen (ILD) werden neue molekulare Biomarker benötigt. Die Gewinnung epithelialer Lining Fluid (ELF) mittels des Bronchoscopic Microsampling (BMS) könnte hierfür eine vielversprechende Methode sein. Im Gegensatz zur BAL kann ELF aus einem vordefinierten Lungensubsegment gewonnen werden. Ziel dieser Machbarkeitsstudie war es zu prüfen, ob mittels der BMS-Methode ELF zur Analyse von miRNA gewonnen werden kann.

Material und Methoden: ELF wurde aus 1 – 3 Subsegmenten von 10 Patienten mit idiopathischer Lungenfibrose (IPF) und 4 Patienten mit anderen ILDs gewonnen. Die BAL erfolgte aus dem Mittellappen oder der Lingula. Die Extraktion der RNA wurde mittels eines modifizierten Protokolls mit dem AllPrep DNA/RNA Mini Kit (Qiagen) durchgeführt. Die Quantität der Proben wurde mittels eines Spectrophotometers (NanoDrop Technologies) gemessen und die Qualität mit dem Agilent 2100 Bioanalyzer und dem Agilent RNA 6000 Pico Kit bestimmt. Die miRNA-Expressionsanalysen wurden mit dem GeneChip® miRNA 3.0 Array (Affymetrix) durchgeführt.

Ergebnisse: Komplikationen bei der Probenentnahme (BAL, BMS) wurden nicht beobachtet. Die Extraktion von miRNA aus den gewonnenen Proben gelang zuverlässig bei allen entnommenen Proben. Im Median konnten 86 ng/µl totaler RNA aus den BMS-Proben entnommen werden. Insgesamt konnten 40 Proben den miRNA-Expressionsanalysen zugeführt werden. Die gematchten Proben von BAL und BMS bei IPF zeigten ein Expressionmuster mit 51 hochsignifikant differentiell exprimierten miRNAs.

Schlussfolgerungen: In dieser Studie ist es erstmals gelungen, ausreichende Mengen von ELF mittels der BMS-Methode zur Analyse von miRNA-Expressionsmustern zu gewinnen. Zusätzlich konnte eine signifikant differentielle Expression von miRNAs der BMS-Proben im Vergleich zu den BAL-Proben bei Patienten mit IPF festgestellt werden.