Die langen nicht-kodierenden RNAs CASC9 und HOTAIR als Biomarker für Kopf-Hals-Plattenepithelkarzinome

Einleitung:

Eine Fehlregulation von langen, nicht-kodierenden RNAs (lncRNA), die zelltypspezifisch wesentliche zelluläre Prozesse regulieren, sind an der Onkogenese von Malignomen beteiligt. Da nur wenig über lncRNAs in Plattenepithelkarzinomen (PEC) im Kopf-Hals-Bereich (HN) bekannt ist, wollen wir relevante lncRNAs in HNSCC identifizieren und funktionell charakterisieren.

Methoden:

Über Recherchen der TANRIC Datenbank und Literatur wurden die lncRNAs CASC9 und HOTAIR als Kandidaten identifiziert und eine Expressionsanalyse mit RT-qPCR in 21 PEC HN-Zelllinien und in 98 HNPEC + 68 Kontrollgeweben durchgeführt. Für funktionelle Analysen überexprimierten wir CASC9 nach lentiviraler Transduktion in Zellinien (HaCaT, FADU) mit geringer endogener Expression und unterdrückten die CASC9 Expression mit shRNA in einer überexprimierenden HNPEC-Zellinie (UMSCC 14A) um Proliferation, Clonogenität über Koloniebildungsassay, Chemosensitivität mittels MTT-Assay und Migration über Ibidi-Wundheilungsassay zu messen.

Ergebnisse:

Eine spezifische Überexpression beider lncRNAs lag in der Mehrzahl der Tumorgewebe und in 17 von 21 PEC HN-Zellinien vor. Eine kombinierte Expressionsanalyse beider lncRNAs erhöhte die Spezifität des Tumornachweises. Eine deutliche CASC9 Überexpression charakterisiert auch PEC anderer Gewebe (Blase, Zervix, Lunge, Uterus). Eine verminderte Expression bestand in Prostata-, Nierenzell- und Schilddrüsenkarzinomen. In HNPEC-Zelllinien ließ sich kein Einfluss von CASC9 auf die Proliferation, Clonogenität oder Migration darstellen.

Schlussfolgerung:

Die lncRNAs CASC9 und HOTAIR werden spezifisch in Plattenpithelkarzinomgeweben deutlich überexprimiert und bieten sich hierfür als exzellente Biomarker an.

Publication History

Publication Date:
23 April 2019 (online)