GENES DOWNREGULATED PELA VIA DE SILENCIAMENTO MYC IDENTIFICADOS COM A ANÁLISE DE RNA-SEQ COMO POTENCIAIS BIOMARCADORES PROGNÓSTICOS NO ADENOCARCINOMA GÁSTRICO

A superexpressão do gene MYC é um fenômeno comum na carcinogênese do estômago, o que contribui para a proliferação celular descontrolada da mucosa gástrica. Todos os anos, 1 milhão de novos casos são diagnosticados e 700.000 morrem desta doença em todo o mundo. É indiscutível a necessidade do diagnostico precoce, embora a única possibilidade de cura destes pacientes ainda permaneça na ressecção tumoral, gastrectomia subtotal ou total, na dependência da localização do tumor no estômago com margem macroscópica livre de tumor de pelo menos 5cm, além de linfadenectomia extensa que seja no mínimo D2. Nesse estudo usamos os dados públicos GSE81265 gerados com RNA-seq das amostras gástricas silenciada e não silenciada originadas de duas linhagens gástricas ACP02: Difuso e ACP03: Intestinal, caracterizadas pela amplificação do MYC e que foram transfectadas com siRNAs targeting MYC. Foram identificados os genes downregulated alvos do MYC em ACP02 (TTLL12, CDKN3, CDC16) e ACP03 (PTPRA, UBE2T, MZT2B) com valores de Log2 (|FC: Fold-change| ≥10; FDR <0.05). Validamos esses genes usando qRT-PCR, western blot e imuno-histoquímica (IHQ) em 213 amostras de tumores gástricos de pacientes e as suas expressões foram correlacionadas com dados clinicopatológicos e sobrevivência. Altos níveis de mRNA e proteína de TTLL12, CDC16 e UBE2T foram fortemente associados com estágios precoce e avançado de GC do tipo difuso e foram capazes de prever metástases à distância. A taxa de sobrevida global de pacientes com TTLL12 superexpresso foi a maior, enquanto que os pacientes que superexpressaram CDC16 e UBE2T foi a menor sobrevida. Em contrapartida, altos níveis de mRNA e proteína de MZT2B, CDC16 e UBE2T foram fortemente associados com estágio avançado de GC do tipo intestinal, sendo capazes de prever metástases à distância. Apenas os pacientes que superexpressaram CDC16 exibiram menor sobrevida. Os níveis de expressão de PTRPA e o CDKN3 não apresentaram diferenças significativas em todas as amostras e não foram associados com metástase. Em conclusão, esses seis genes são potenciais biomarcadores moleculares para o prognóstico do GC.

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Article published online:
23 October 2019