Abstract
Objective Abnormalities in the eutopic endometrium of women with endometriosis may be related
to disease-associated infertility. Although previous RNA-sequencing analysis did not
show differential expression in endometrial transcripts of endometriosis patients,
other molecular alterations could impact protein synthesis and endometrial receptivity.
Our aim was to screen for functional mutations in the transcripts of eutopic endometria
of infertile women with endometriosis and controls during the implantation window.
Methods Data from RNA-Sequencing of endometrial biopsies collected during the implantation
window from 17 patients (6 infertile women with endometriosis, 6 infertile controls,
5 fertile controls) were analyzed for variant discovery and identification of functional
mutations. A targeted study of the alterations found was performed to understand the
data into disease's context.
Results None of the variants identified was common to other samples within the same group,
and no mutation was repeated among patients with endometriosis, infertile and fertile
controls. In the endometriosis group, nine predicted deleterious mutations were identified,
but only one was previously associated to a clinical condition with no endometrial
impact. When crossing the mutated genes with the descriptors endometriosis and/or endometrium, the gene CMKLR1 was associated either with inflammatory response in endometriosis or with endometrial
processes for pregnancy establishment.
Conclusion Despite no pattern of mutation having been found, we ponder the small sample size
and the analysis on RNA-sequencing data. Considering the purpose of the study of screening
and the importance of the CMKLR1 gene on endometrial modulation, it could be a candidate gene for powered further
studies evaluating mutations in eutopic endometria from endometriosis patients.
Resumo
Objetivo Anormalidades no endométrio eutópico de mulheres com endometriose podem estar relacionadas
à infertilidade associada à doença. Embora a análise prévia de sequenciamento de RNA
não tenha evidenciado expressão diferencial em transcritos endometriais de pacientes
com endometriose, outras alterações moleculares poderiam afetar a síntese de proteínas
e a receptividade endometrial. Nosso objetivo foi rastrear mutações funcionais em
transcritos de endométrios eutópicos de mulheres inférteis com endometriose e de controles
durante a janela de implantação.
Métodos Os dados do sequenciamento de RNA de biópsias endometriais coletados durante a janela
de implantação de 17 pacientes (6 mulheres inférteis com endometriose, 6 controles
inférteis, 5 controles férteis) foram analisados para a descoberta de variantes e
a identificação de mutações funcionais. Um estudo direcionado das alterações encontradas
foi realizado para compreender os dados no contexto da doença.
Resultados Nenhuma das variantes identificadas foi comum a outras amostras dentro do mesmo grupo,
assim como nenhuma mutação se repetiu entre pacientes com endometriose, controles
inférteis e férteis. No grupo de endometriose, foram identificadas nove mutações deletérias
preditas, mas apenas uma foi previamente associada a uma condição clínica sem impacto
endometrial. Ao cruzar os genes mutados com os descritores endometriose e/ou endométrio, o gene CMKLR1 foi associado a resposta inflamatória na endometriose e a processos endometriais
para estabelecimento da gravidez.
Conclusão Apesar de nenhum padrão de mutação ter sido encontrado, ponderamos o pequeno tamanho
da amostra e a análise dos dados de sequenciamento de RNA. Considerando o objetivo
do estudo de triagem e a importância do gene CMKLR1 na modulação endometrial, este poderia ser um gene candidato para estudos adicionais
que avaliem mutações no endométrio eutópico de pacientes com endometriose.
Keywords
endometriosis - infertility - eutopic endometrium - RNA-sequencing - mutation
Palavras-chave
endometriose - infertilidade - endométrio eutópico - sequenciamento de RNA - mutação
